世界首例多抗蛋白测序：Rapid Novor联合创始人马斌博士专访|凯风生态
近日，凯风创投A轮独家投资企业Rapid Novor成为世界首个成功完成多克隆抗体蛋白的全序列直接测序的团队。未来几年，Rapid Novor将继续扩大蛋白质测序业务，进一步开发在肿瘤学、疫苗学以及自免疫性疾病领域的产品服务管线。凯风创投将长期支持Rapid Novor在蛋白测序领域的深耕，为新诊断试剂和抗体疗法的研发提供助力。
以下为Rapid Novor联合创始人马斌博士的专访直接全序列从头测序，为什么说这是生命科学领域的重要里程碑呢？
马斌：能够对多抗进行测序标志着蛋白从头测序技术从对单一蛋白进行测序跃升到了能够对相似蛋白的混合物进行测序，这在蛋白测序技术上是一个质变，离对整个蛋白组进行从头测序更近了一步，而后者对生物科学领域将会产生革命性的影响。仅从抗体行业来言，现有其他的抗体发现技术基本上都需要依赖基因测序来获得抗体序列，这样就需要在抗体发现的整个过程中想办法一直将抗体蛋白和基因进行关联，这大大限制了抗体筛选过程中所能采用的生物和生化实验的手段。我们对多抗蛋白直接测序首次使得这种关联不再必要，让整个过程只需要依赖蛋白分子就可以完成，从而帮助科学家直接从动物血液的抗体库中挖掘和捕获天然功能性抗体。相比其他技术，我们的REpAb®抗体研发平台能够在更短的周转时间内发现更多有效和有实用价值的抗体。
能否告诉我们REpAb®是如何进行测序的？
马斌：REpAb®抗体发现平台在Rapid Novor自主开发的生物信息学算法和基于质谱的蛋白质组学实验室的基础上，结合了我们在蛋白测序和蛋白质化学技术的最近研究进展。REpAb®的测序流程从多克隆抗体蛋白样本或免疫后血液样本开始，首先我们将样本进行亲和纯化和酶切，对其进行液相色谱串联质谱法（LC-MS/MS）测定，然后我们采用独到的生物信息学软件将所得到的质谱数据进行分析处理，并由蛋白质组学专家最终评估，得到重链轻链配对的全长抗体序列，用于后续的重组表达和测试。
为什么这项工作在诊断学和新型抗体疗法中如此重要？
马斌：多抗由免疫动物天然产生，比单抗更容易制备，并且具有更好的亲和力，然而，多抗存在的批次间差异问题使得它很难在抗体药物和体外诊断研发中得到广泛应用。我们的技术可以从多抗样品中获取多个单抗序列信息，因此我们就可以利用这些序列信息生产出既有多抗的亲和力又有单抗的可重复性的混合抗体。目前的抗体药物和诊断抗体研发方法不能直接针对抗体蛋白进行分析和鉴定，因此很难全面捕获到重要的功能性抗体，而REpAb®技术提供了直接有效的途径来获取关键的抗体信息，并且保证可重复性，能够大大减轻研究的工作量和不确定性。
只使用蛋白质组学进行测序意味着既不需要细胞系也不需要DNA序列信息，
您能举例说明这一技术亮点有哪些优势吗？
马斌：蛋白测序路线更有优势的最重要原因可以归结为一句话：细胞比蛋白更难获得。例如，我们的一些客户使用杂交瘤来生产单克隆抗体，但是很不幸的因为停电等原因失去了细胞系。但是通常他们还存有极少量的抗体蛋白，我们便可以对这些蛋白进行测序，使丢失的抗体“再生”。再例如，在免疫动物体内，抗原特异性抗体在血液中大量存在，而产生这些抗体的细胞则主要存在于脾脏等组织里，获得血液显然要比获得细胞容易得多，在对人体进行取样时尤其是这样。第三个例子跟一种叫做多发性骨髓瘤的癌症有关。骨髓瘤的癌细胞居于骨髓中，通常需要有创的骨髓穿刺进行分析，而这些癌细胞会分泌一种特异性抗体到血液里。我们的蛋白测序技术就可以从患者的血液样本中对这些抗体进行分析检测。基于这个思路，我们开发了用于发现多发性骨髓瘤患者复发的血检技术EasyM™，靠无创的血检达到了基于骨髓的有创检测方法的灵敏度。
这项抗体测序技术在肿瘤学、疫苗学和自身免疫性疾病领域又有哪些应用和影响呢？
马斌：REpAb®在这些领域的应用潜能不可限量！首先，这项技术可以帮助研究者直接从免疫动物或人类患者的血液中发现新的抗体药物。能够从人类血液中发现抗体将尤其具有前景，因为人体抗体临床使用中免疫原性大大降低，因此就增加了抗体药物研发的安全性和成功率。此外，在癌症、疫苗反应和自身免疫性疾病中，我们的免疫系统会产生针对某些特定抗原的抗体，对这些循环血液中的抗体进行测序，就可以发现关于免疫系统的重要信息，这些信息可以用于诊断疾病，或者协助疾病的治疗。
我们预计未来的疾病治疗方向将会是通过协助我们自身的免疫系统来对抗疾病，Rapid Novor的抗体测序技术在未来可提供体液免疫反应的完整抗体信息，这将帮助临床医生制定治疗方案，上面提到，我们目前正在利用我们的测序技术开发无创、敏感和准确的检测方法EasyM™，用于追踪血癌多发性骨髓瘤。
这种突破性的测序技术会对整个生命科学领域产生什么影响呢？
马斌：就像当年高通量DNA测序一样，对蛋白分子的直接高通量测序为科学家们提供了一个全新的能力。我们认为高通量蛋白质测序技术将对生命科学领域产生比肩于高通量DNA测序技术的重大影响。DNA和蛋白质都是维系生命活动的重要分子，与DNA相比，蛋白质与疾病的关系更为密切，并且包含DNA所不具备的信息，如蛋白定量信息和翻译后修饰信息，因此蛋白质是十分理想的生物标志物。而抗体作为重要的蛋白质类别，大量存在于循环血液中，对它们进行测序将有助于推进治疗药物和生物标志物的发现。
是什么让您的团队的蛋白质测序和质谱分析技术如此先进和可靠？
马斌：首先，我们聚集了一支世界级的多学科团队，致力于蛋白质从头测序技术的研发，我们的目标是继续引领下一代蛋白质测序技术的发展。第二，我们在这些学科领域中拥有丰富深入的专业知识和多年的积累，例如，我自2000年以来就一直在进行基于质谱的蛋白质从头测序的研究，当时质谱作为蛋白质组学的强大工具刚刚得到重视，从那时起，我开发了广泛用于学术界和工业界的蛋白质从头测序软件。第三，Rapid Novor在单克隆抗体测序服务方面取得的最初成功使我们接触到了大量的具有挑战性的抗体样品，通过攻克这些具有挑战性的样本，我们积累了越来越多的专业知识和经验，并通过开发新的机器学习算法来进一步精进我们的计算软件。
客户选择Rapid Novor的理由是什么？
马斌：Rapid Novor是蛋白测序领域的领跑者，凭借在蛋白质组学，生物信息学和大数据方面超过20年的经验，已经成功对3000多个蛋白质进行测序，测序数量和速度均为世界第一。受益于我们技术的研究者和机构遍布全球各地，我们提供的蛋白序列信息大大推动了他们的研发工作。同时，我们的优质的售前售后服务也是客户选择我们的原因之一。我们的销售和技术团队努力对来自全球客户的问询做出最及时的回应，这也为公司赢得了友好、专业和值得信赖的国际声誉。
Rapid Novor未来几年内在发展其蛋白质测序技术上有什么计划？
马斌：我们将不断探索蛋白测序技术的更多应用。由于蛋白质从头测序是一项新兴技术，在公司成立初期，我们花了巨大的精力进行市场教育，让潜在客户了解这项技术的可用性，通过这个过程，越来越多的人认识了这项技术。与此同时，通过与客户和合作伙伴的深入交流，我们也发现了这项测序技术的许多新应用。除了我们之前讨论的应用之外，我相信科学家们会不断在他们的研究方向发掘出我们蛋白测序技术的新应用。我们将继续与全球各地的客户合作，满足他们对下一代蛋白质测序技术不断增长的需求。
抗体测序的未来是什么，Rapid Novor将在其中扮演怎样的角色？
马斌：我们坚信，为了确保质量和可重复性，每一批生产出来的抗体都应该进行测序，同时，人类血液中的抗体也需要不断被监测，以检测正在发生的或潜在的疾病。这些应用场景都会产生大量的测序需求。作为世界上最大的抗体蛋白测序团队，我们迄今已测序了3000多种抗体，但我可以预见到未来每年需要测序的抗体将数以万计甚至十万计。Rapid Novor将继续保持在下一代蛋白质测序领域的领导地位，为整个生命科学领域的研究者提供值得信赖的测序服务。在此同时，我们也会有选择性的针对一些特定疾病利用我们的测序技术开发检测产品。
Rapid Novor还有哪些进行中的项目？
马斌：在过去的经验中，我们的测序技术被广泛应用于药物和诊断剂研发中的质量控制环节，考虑到这一需求，我们推出了MATCHmAb™这一全新服务，目前正在现有的客户群中进行试用。MATCHmAb™将为抗体供应商和抗体用户提供序列信息，以保证抗体的可重复性，使他们不再受到批次间差异问题的困扰。我们欢迎各界研究者和业内人士和与我们联系，咨询有关这项新服务的更多信息。
此外，基于致力于改善人类健康的愿景，我们还将蛋白测序平台应用于临床中，目前正在开发的EasyM™通过跟踪M蛋白生物标志物来监测多发性骨髓瘤的复发，我们已经进行了两项临床试验，数据表明我们的方法比起现行的血检方法灵敏度提高了上千倍，并可以提前半年检出复发。REpAb®多克隆测序技术也将有助于推动在骨髓瘤这一领域的努力。最后，以蛋白测序技术为基础，我们还开发了NovorIg™平台，NovorIg™可以定量检测血清中不同的抗体序列，并追踪其浓度变化，对免疫反应进行量化，在疫苗研究和自身免疫监测方面都有重大的应用价值。
关于Rapid Novor
Rapid Novor, Inc.是世界领先的抗体蛋白测序公司，拥有加拿大最大的质谱蛋白组学实验室。Rapid Novor团队通过其行业领先的REmAb®平台，以及现在的突破性REpAb®抗体研发平台，持续推动蛋白质测序的发展，这两个平台都可以直接对抗体蛋白质进行测序，不需要细胞系或DNA序列信息。该团队在蛋白质组学、生物信息学和大数据处理方面拥有20多年的专业经验，是世界第一个提供区分异亮氨酸和亮氨酸商业解决方案的公司（WILD®）。Rapid Novor致力于通过下一代蛋白质测序推动生命科学的发展，促进人类健康。